一、案例解析
甲公司是一家民营企业，主要生产通讯设备和计算机软硬件及外围设备，自设立以来经营状况一直很好，积累了大量的资金。2007年年底，甲公司决定将闲置的 500万元对外进行投资，并计划于2009年5月收回后用于进一步扩大经营规模。2008年1月，甲公司将此500万元购买了乙公司60%的股权，成为其 第一大股东。乙公司是北京市中关村科技园区的高新技术企业，享受15%的所得税优惠税率。2008年，乙公司实现税后利润200万元，对此利润甲公司应如 何处理呢？

方案一：甲公司转让股权前，乙公司分配股利
假设乙公司决定将税后利润的50%用于分配现金股利，2009年4月，甲公司分得 60万元。2009年5月，甲公司将其拥有的乙公司60%的股权全部转让，转让价格为550万元，转让过程中除发生印花税外无其他税费。甲公司2009年 的生产、经营所得为100万元（企业所得税税率为25%），结合现行政策甲公司应纳税额计算如下：
1、印花税。根据《印花税暂行条例》规定：产权转移书据按所载金额0.5‰贴花，包括财产所有权和版权、商标专有权、专利权、专有技术使用权等转移书据，均应当按规定缴纳印花税。所以，甲公司应缴纳印花税为：550×0.5‰=0.275（万元）。
2、企业所得税。《企业所得税法》规定：“企业取得的符合条件的居民企业之间的股息、红利等权益性投资收益为免税收入。” 《企业所得税法实施条例》规定：“符合条件的居民企业之间的股息、红利等权益性投资收益，是指居民企业直接投资于其他居民企业取得的投资收益，不包括连续 持有居民企业公开发行并上市流通的股票不足12个月取得的投资收益。”因此，甲公司取得的60万元现金股利属于股息性所得，按税法规定免税。
同时，《国家税务总局关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》（国税发[2000]118号）规定：“企业股权投资转让所得或损失是指企业因收回、转 让或清算处置股权投资的收入减除股权投资成本后的余额。企业股权投资转让所得应并入企业的应纳税所得，依法缴纳企业所得税。”则甲公司取得的股权投资转让 所得应纳企业所得税为：（550－500－0.275）×25%=12.43125（万元）；自营业务应纳企业所得税为：100×25%=25（万元）。
以上甲企业应纳各种税额合计为：0.275+12.43125+25=37.70625（万元）。

方案二：甲公司转让股权前，乙公司保留盈余不分配
2009年5月，甲公司将其拥有的乙公司60%的股权全部转让，转让价格为610万元（因为乙企业保留盈余不分配导致股权转让价格增高），转让过程除发生印花税外无其他税费，其他条件同上。则甲公司应纳税额计算如下：
1、应缴纳印花税为：610×0.5‰=0.305（万元）。
2、企业所得税。《国家税务总局关于企业股权转让有关所得税问题的补充通知》（国税函[2004]390号）规定：“企业在一般的股权（包括转让股票或股 份）买卖中，应按《国家税务总局关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》（国税发［2000］118号）有关规定执行。股权转让人应分享的被投资方累 计未分配利润或累计盈余公积应确认为股权转让所得，不得确认为股息性质的所得。企业进行清算或转让全资子公司以及持股95%以上的企业时，应按《国家税务 总局关于印发〈企业改组改制中若干所得税业务问题的暂行规定〉的通知》（国税发[1998]97号）的有关规定执行，即：投资方应分享的被投资方累计未分 配利润和累计盈余公积应确认为投资方股息性质的所得，为避免对税后利润重复征税，影响企业改组活动，在计算投资方的股权转让所得时，允许从转让收入中减除 上述股息性质的所得。”可见甲公司该项转让股权的行为属于上述规定中的一般股权买卖，取得的股权投资转让所得应纳企业所得税为： （610－500－0.305）×25%=27.42375（万元）；甲公司的自营业务应纳企业所得税为：100×25%=25（万元）。
以上甲公司应纳各项税额合计为：0.305+27.42375+25=52.72875（万元）。
由此可见，方案一与方案二相比可以节约税款15.0225万元（52.72875-37.70625），甲公司应该选择方案一。